La parrocchia fa riferimento alla chiesa di Sant’Antonio da Padova; la chiesa nasce grazie all’impegno del vescovo Mons. Margaria e di Padre Geremia, che il 2 ottobre 1931 acquistano il terreno per costruire la chiesa e la casa parrocchiale. Il 31 dicembre dello stesso anno, viene benedetto il luogo e, il 19 giugno 1932, posata la prima pietra.
Già il 13 giugno 1933, in occasione della festa del Santo Patrono, si celebra la prima messa, nonostante la chiesa non sia ancora completata. La casa parrocchiale viene terminata nel 1935, permettendo al parroco di trasferirsi a Orte Scalo, mentre nel giugno 1937 la chiesa, ormai funzionale, viene benedetta e aperta al culto.
Il 29 agosto 1943, un bombardamento danneggia gravemente l’edificio, distruggendo tetto, volte e vetrate. I lavori di ripristino proseguono negli anni successivi: nel 1952 viene completato il campanile e nel dicembre 1953 sono consacrate le tre campane.
La chiesa rappresenta oggi un simbolo della fede e della resilienza della comunità di Orte Scalo.